化学生物学系生物有机化学教研室成立于上个世纪五十年代，历经多次的院系调整、学科整合及北京医科大学与北京大学的合并演变而来，学部委员王序教授、何端僧教授、董领娇教授、蔡孟深教授、岳宝珍教授、李润涛教授先后担任教研室主任。

　　生物有机化学教研室有良好的科研传统和学术积淀，其中多肽化学、糖化学及杂环化学研究在国内有较大的影响。目前教研室有教职员14名，包括3名教授、9名副教授、2名讲师，其中博士生导师3人，硕士生导师7人，10人具有博士学位。目前开设了本科生、硕士和博士研究生课程共 17 门次，以有机化学、生物有机化学、糖化学和杂环化学为主要代表。在科研方面，目前研究工作主要集中在基于杂环、糖类化合物的化学生物学和创新药物研究，主要研究方向有三个：生物有机及有机小分子生物学功能研究、杂环化合物的合成及生物学功能研究、糖化学与化学糖生物学。目前承担科技部“重大新药创制”科技重大专项、国家重点基础研究发展计划（973计划）、国家自然科学基金（包括重大研究计划、重点和面上项目）、教育部创新团队、教育部博士点基金等课题多项。