化学生物学系建立于2000年，由原来的生物无机系和生物有机系组成，岳宝珍教授任系主任。2003年药物分析研究室并入化学生物学系组成新的化学生物学系，由李润涛教授任主任。现任系主任为李中军教授，系副主任为杨晓改教授和凌笑梅教授。化学生物学系拥有一支高素质的教学、科研队伍。全系现有教职员37人，其中中国科学院院士1名，博士生导师11人，硕士生导师12人，教授10人，副教授16人，其中具有博士学位的教师22人。化学生物学系先后涌现出以王夔、蔡孟深、董善年等为代表的一批杰出学者，具有很高的学术造诣。